Octopressで独自ドメインを設定するには、受け入れドメイン名を書いたCNAMEって名前のファイルを リポジトリのルートに置くだけでいい。でもそれはsourceフォルダ直下の事だぞ。
octopressフォルダ直下や、実際のリポジトリルートである_deploy直下ではダメだから気をつけろ!